Publication: Fundamental study of bioactive peptides on selected Alexandrium spp.at different growth phases
dc.contributor.affiliation | #PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE# | en_US |
dc.contributor.author | Nurul Ashima Hamdan | en_US |
dc.contributor.supervisor | Noraslinda Muhamad Bunnori, Ph.D | en_US |
dc.contributor.supervisor | Normawaty Mohammad Noor, Ph.D | en_US |
dc.date.accessioned | 2024-10-09T07:47:51Z | |
dc.date.available | 2024-10-09T07:47:51Z | |
dc.date.issued | 2020 | |
dc.description.abstract | The naturally occurring phenomenon of harmful algae blooming (HAB) at the water column brought detrimental effects to the economy as well as the environmental health of the water ecosystem. Most cases of HABs reported in Malaysia waters are dominated by dinoflagellates Alexandrium spp. with some of the species were reported to cause shellfish poisoning. In this study, two Alexandrium spp.; A. tamiyavanichii and A. leei with different toxicity levels were analyzed using proteomic approaches involving two-dimensional PAGE and HPLC analysis. The growth pattern of both species were identified and compared by using protein profiles at each growth phases. Protein expression reduced throughout the growth phases of A. tamiyavanichii but elevated during stationary phase of A. leei. A short duration of stationary phase suggests the continuous expression of growth proteins in A. leei. GNAT family acetyltransferase and lipases were successfully identified enzyme protein in A. tamiyavanichii and A. leei respectively with growth regulatory functions. The toxin profiles of both species exhibited higher level of toxin content in A. tamiyavanichii with 88 mol % of total toxins recorded as compared to 12 mol% in A. leei. The highest toxin content was recorded during exponential phase of A. tamiyavanichii with dominance of GTX4 and STX congeners. Further investigation on the toxicity effects of Alexandrium spp. was studied by using oysters where the shellfish are fed with toxic A. tamiyavanichii and non-toxic A. leei. LC-MS results of the two up-regulated spots in oysters fed with A. tamiyavanichii were identified as arginine kinase and transgelin. The up-regulation of the proteins was induced as responsive mechanism towards accumulation of the toxic species A. tamiyavanichii. These responses reflect the oyster stability during HAB outbreak. Fundamental studies of dinoflagellates from its molecular as well as byproduct analysis are useful to understand the biochemistry of the HAB species. The findings from this study can provide the basis knowledge on the biochemical properties of HAB species and the behavioral of affected organisms. | en_US |
dc.description.abstractarabic | لقد سببت ظاهرة انتشار الطحالب المضرة في الماء آثارا مدمرة للاقتصاد وللصحة البيئية والنظام البيئي المائي. أن معظم حالات انتشار الطحالب المضرة الموثقة في المياه الماليزية يسيطر عليها رتبة الألكساندريوم من شعبة السوطيات الدوارة، حيث تسبب بعض الأنواع تسمم الصدفيات. تم في هذه الدراسة تحليل نوعي أليكساندريوم تاميافانيتشي (Alexandrium tamiyavanichii) وأليكساندريوم ليي (Alexandrium leei) بمستويات سمية مختلفة باستخدام الفصل الكهربائي لهلام كبريتات دوديكل الصوديوم متعدد الأكريلامايد (PAGE) والتحليل الكروماتوغرافي السائل العالي الأداء (HPLC). تم تحديد نمط النمو لكلا النوعين وتحليلهما بشكل أوسع عن طريق استخدام التنميط البروتيني في كل مراحل النمو. تم تخفيض التعبير البروتيني طوال مراحل النمو لنوع أليكساندريوم تاميافانيتشي، ولكنه ارتقى خلال المرحلة الثابتة لنوع أليكساندريوم ليي. تم التعرف بنجاح على أسيتيل ترانسفيراز من عائلة GNAT في نوع أليكساندريوم تاميافانيتشي، والليبازات في نوع أليكساندريوم ليي كبروتينات إنزيمية بوظائف تنظيم النمو. أظهرت بروفايلات السمية لكل من النوعين مستوى أعلى للسمية في نوع أليكساندريوم تاميافانيتشي بقيمة 88 مول نسبي من إجمالي السموم المسجلة، مقارنة بـ 12 مول نسبي للأليكساندريوم ليي. تم تسجيل أعلى محتوى للسموم خلال طور النمو المطرد لأليكساندريوم تاميافانيتشي مع هيمنة مجانسات GTX4 و STX. تم القيام بالمزيد من التحقيقات في آثار سمية رتبة الأليكساندريوم في المحار حيث تم تغذية المحار بالأليكساندريوم تاميافانيتشي السام وأليكساندريوم ليي غير السام. تم تحديد نتائج LC-MS من المناطق المرفوعة في المحارات التي تغذيها بأليكساندريوم تاميافانيتشي بكونها كينازات الأرجينين وترانسجيلين. تم استنتاج أن التنظيم الرفعي للبروتينات كان آلية استجابة لتراكم النوع السام أليكساندريوم تاميافانيتشي في المحار. أظهر هذه الاستجابات قدرة تحمل المحار في مواجهة انتشار الطحالب المضرة. تعتبر الدراسات الأساسية لشعبة السوطيات الدوارة كتعبير جزيئي وتحليل منتجاتها الثانوية مفيدة لفهم النشاط البيوكيميائي لأنواع الطحالب المضرة المنتشرة. بإمكان نتائج هذه الدراسة أن توفر معلومات أساسية حول الخصائص البيوكيميائية لأنواع الطحالب المضرة المنتشرة في المياه الماليزية وتأثيراتها المتسلسلة على النظام البيئي المائي. | en_US |
dc.description.callnumber | t QP 632 M37 N974F 2020 | en_US |
dc.description.identifier | Thesis : Fundamental study of bioactive peptides on selected Alexandrium spp.at different growth phases /by Nurul Ashima bt Hamdan | en_US |
dc.description.identity | t11100392681NurulAshimaBtHamdan | en_US |
dc.description.kulliyah | Kulliyyah of Science | en_US |
dc.description.nationality | Malaysian | en_US |
dc.description.notes | Thesis (MSBTS)--International Islamic University Malaysia, 2020. | en_US |
dc.description.physicaldescription | xv, 90 leaves : colour illustrations ; 30cm. | en_US |
dc.description.programme | Master in Science (Biotechnology) | en_US |
dc.identifier.uri | https://studentrepo.iium.edu.my/handle/123456789/11438 | |
dc.language.iso | en | en_US |
dc.publisher | Kuantan, Pahang : Kulliyyah of Science, International Islamic University Malaysia, 2020 | en_US |
dc.subject.lcsh | Marine toxins -- Toxicology | en_US |
dc.subject.lcsh | Harmful Algal Bloom -- physiology | en_US |
dc.subject.lcsh | Environmental Exposure | en_US |
dc.subject.lcsh | Alexandrium | en_US |
dc.title | Fundamental study of bioactive peptides on selected Alexandrium spp.at different growth phases | en_US |
dc.type | Master Thesis | en_US |
dspace.entity.type | Publication |
Files
Original bundle
License bundle
1 - 1 of 1