Publication:
A pilot study on association of lipoprotein a (LPA) gene copy number variation (CNV) and apolipoprotein e (APOE) gene polymorphism with acute myocardial infarction (AMI) in young adults

cris.virtual.department#PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE#
cris.virtual.orcid#PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE#
cris.virtualsource.departmente714c60e-ae27-41f6-a9da-0843fb00ed91
cris.virtualsource.orcide714c60e-ae27-41f6-a9da-0843fb00ed91
dc.contributor.authorIffah Irdhina Mohd Zamri
dc.contributor.supervisorNor Zamzila Abdullah, Ph.D
dc.contributor.supervisorNorlelawati A.Talib, Ph.D
dc.date.accessioned2024-11-29T00:29:02Z
dc.date.available2024-11-29T00:29:02Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractAcute myocardial infarction (AMI) is the most severe manifestation of coronary artery disease which is the leading cause of death globally. In Malaysia, there is an increasing number of AMI among young patients aged less than 45 years. The presentation of AMI at younger age suggests the possibility of genetic predisposition. Since LPA and APOE genes are known to be involved in lipid metabolism, they may contribute to the development of atherosclerosis leading to AMI. However, to date, there is no reported study on the association of LPA copy number variations (CNV) and APOE polymorphism with AMI in young patients. The aim of the current study is to assess the association of LPA CNV and APOE polymorphism with AMI in young adults. This study was conducted on 40 men grouped into 20 young acute myocardial infarction (YAMI) patients and 20 healthy controls. DNAs were purified from blood. The APOE genotyping was performed using multiplex PCR technique while LPA CNV was performed using digital PCR and the analysis of copy number was performed using QIAcuity Software Suite version 1.2 (QIAgen, Germany). Chi –square and Kruskall-wallis tests were used for data analysis. In order to improve the statistical power to signify the role of APOE polymorphism in CAD, meta-analyses were performed from this current result and selected studies among Asian populations using Comprehensive Meta-analysis version 3 software program. No significant association of LPA CNV with AMI was found (p = 0.459) in young adults. Although APOE genotypes and alleles were not significantly associated with AMI in young adults (p=0.484), this study found that E3/E3 genotypes and e3 allele were the commonest genotypes and allele. Lipid parameters were also found to be not significantly associated with LPA CNV status as well as APOE genotypes. However, from the current meta-analysis, APOE genotypes of E3/E3 was found to be protective whilst E3/E4 and e4 allele were found to increase the risk of CAD. In conclusion, this study found that there was no association of LPA CNV and APOE polymorphism with AMI in young adults, but the meta-analysis reaffirmed the role of APOE genotypes and e4 allele in the development of CAD. In pursuance of assessing the contribution of LPA gene CNV and APOE genotypes to our local population, a larger sample representation is recommended.
dc.description.abstractarabicاحتشاء عضلة القلب الحاد (AMI) هو أشد مظاهر مرض الشريان التاجي الذي هو السبب الرئيسي للوفاة على مستوى العالم. في ماليزيا، هناك عدد متزايد من AMI بين المرضى الشباب الذين تقل أعمارهم عن 45 عاما. عرض AMI في سن أصغر يشير إلى إمكانية الاستعداد الوراثي. بما أن جينات LPA و APOE معروفة بأنها تشارك في استقلاب الدهون، فقد تساهم في تطور تصلب الشرايين مما يؤدي إلى AMI. ومع ذلك، حتى الآن، لا توجد دراسة ذكرت عن ارتباط اختلافات عدد النسخ LPA (CNV) و APOE polymorphism مع AMI في المرضى الصغار. الهدف من الدراسة الحالية هو تقييم ارتبا LPA CNVو APOE polymorphism مع AMI في البالغين الشباب. أجريت هذه الدراسة على 40 رجلا تم تجميعهم في 20 مريضا من احتشاء عضلة القلب الحاد (YAMI) و 20 مريضا صحيا. تم تنقية DNAs من الدم. تم إجراء التنميط الجيني APOE باستخدام تقنية PCR متعددة بينما تم إجراء LPA CNV باستخدام PCR الرقمي وتم إجراء تحليل رقم النسخ باستخدام الإصدار 1.2 من QIAcuity Software Suite (Qiagen، ألمانيا). تم استخدام اختبارات Chi-square و Kruskall-Wallis لتحليل البيانات. من أجل تحسين القوة الإحصائية للدلالة على دور تعدد الأشكال APOE في CAD، تم إجراء التحليلات الوصفية من هذه النتيجة الحالية ودراسات مختارة بين السكان الآسيويين باستخدام برنامج برنامج التحليل التلوي الشامل 3. لم يتم العثور على ارتباط كبير بين LPA CNV و AMI (p = 0.459) في البالغين الشباب. على الرغم من أن الأنماط الجينية والأليلات APOE لم تكن مرتبطة بشكل كبير بـ AMI لدى البالغين الشباب (p = 0.484)، فقد وجدت هذه الدراسة أن الأنماط الجينية E3/ E3 وأليل E3 كانت أكثر الأنماط الجينية والأليل شيوعا. كما وجد أن بارامترات الدهون لا ترتبط ارتباطا كبيرا بحالة LPA CNV وكذلك الأنماط الجينية APOE. ومع ذلك، من التحليل التلوي الحالي، تم العثور على الأنماط الجينية APOE من E3/ E3 لتكون وقائية في حين تم العثور على أليل E3/ E4 و E4 لزيادة خطر CAD. في الختام، وجدت هذه الدراسة أنه لم يكن هناك ارتباط بين تعدد أشكال LPA CNVو APOE مع AMI في البالغين الشباب، لكن التحليل التلوي أعاد تأكيد دور الأنماط الجينية APOE وأليل E4 في تطوير CAD. سعيا إلى تقييم مساهمة الأنماط الجينية LPA GENE CNV و APOE لسكاننا المحليين، يوصى بتمثيل أكبر للعينات.
dc.description.identifierThesis : A pilot study on association of lipoprotein a (LPA) gene copy number variation (CNV) and apolipoprotein e (APOE) gene polymorphism with acute myocardial infarction (AMI) in young adults / by Iffah Irdhina Mohd Zamri
dc.description.identityG2022670Iffahirdhinamohdzamri
dc.description.kulliyahKulliyyah of Medicine
dc.description.notesThesis (MHSC)--International Islamic University Malaysia, 2024.
dc.description.physicaldescription1 online resource (xvi, 106 leaves) ; color illustrations.
dc.description.programmeMaster of Health Sciences (Clinical Pathology)
dc.identifier.urihttps://studentrepo.iium.edu.my/handle/123456789/23139
dc.language.isoen
dc.publisherKuantan, Pahang : Kulliyyah of Medicine, International Islamic University Malaysia, 2024
dc.titleA pilot study on association of lipoprotein a (LPA) gene copy number variation (CNV) and apolipoprotein e (APOE) gene polymorphism with acute myocardial infarction (AMI) in young adults
dc.typemaster thesis
dspace.entity.typePublication
oairecerif.author.affiliation#PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE#

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
G2022670Iffahirdhinamohdzamri_SEC.pdf
Size:
15.97 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Full text

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed to upon submission
Description:

Collections